Semenjak itu, ia pun aktif berpolitik di Partai Demokrat dan diberi tugas sebagai Komandan Komando Tugas Bersama (KOGASMA). Kemudian, pada 15 Maret 2020, Agus diangkat menjadi Ketua Umum Partai Demokrat periode 2020-2025.
Keluarga
AHY menikahi anak mantan Deputi Gubernur Bank Indonesia, Aulia Pohan bernama Annisa Larasati Pohan pada Juli 2005.
Ketika menikah, AHY merupakan seorang perwira dengan pangkat Letnan satu, saat itu ia berusia 27 tahun, dan Annisa berusia 24 tahun. Annisa juga merupakan co-founder Tunggadewi Foundation
Dari pernikahan itu, ia dikaruniai seorang putri bernama Almira Tunggadewi Yudhoyono.
Pilgub DKI 2017
Kala itu, AHY berpasangan dengan Sylviana Murni akan berhadapan dengan kandidat lain, petahana Ahok-Djarot yang diukung PDIP, Golkar, Hanura, Nasdem dan pasangan Anies Baswedan- Sandiaga Uno didukung oleh Partai Gerindra dan PKS
